對于傳統(tǒng)的光學(xué)顯微鏡,光的衍射讓成像分辨率限制在大約250 nm。如今,超分辨率技術(shù)可以將此提高10倍以上。這種技術(shù)主要通過三種方法實現(xiàn):單分子定位顯微鏡,包括光敏定位顯微鏡(PALM)和隨機光學(xué)重建顯微鏡(STORM);結(jié)構(gòu)照明顯微鏡(SIM);以及受激發(fā)射損耗顯微鏡(STED)。
如何選擇超分辨率技術(shù),這是大家都關(guān)心的。“不幸的是,并沒有簡單的原則來決定使用哪種方法,”英國牛津大學(xué)的博士后研究員Mathew Stracy說。“每一種都有其自身的優(yōu)點和缺點。”
科學(xué)家當然也在想辦法,為特定的項目選擇合適的方法。以色列理工學(xué)院的助理教授Yoav Shechtman表示:“在生物成像的背景下,要考慮的關(guān)鍵因素包括:空間和時間分辨率、對光損傷的敏感性、標記能力、樣本厚度,以及背景熒光或細胞自體熒光。”
工作原理
各種超分辨顯微鏡是以不同的方式工作的。以PALM和STORM為例,在特定時刻,只有一小部分熒光標記激發(fā)或光活化,使得它們能夠高精度地獨立定位。讓所有熒光標記都經(jīng)歷這個過程,這也就帶來了一幅完整的超分辨率圖像。2014年諾貝爾化學(xué)獎的獲得者之一、馬普生物物理化學(xué)研究所主任Stefan Hell表示:“PALM/STORM系統(tǒng)相對容易搭建,但比較難以應(yīng)用,因為熒光基團必須具有光活化能力。局限之處在于它們需要檢測細胞背景下的單個熒光分子,在可靠性上不及STED。”
STED使用激光脈沖來激發(fā)熒光基團,并使用環(huán)形的激光來淬滅熒光基團,只留下中間納米大小的熒光而得到超高分辨率。掃描整個樣本,可生成一幅圖像。“STED的優(yōu)勢在于它是一種按鈕技術(shù),”Hell解釋說。“它用起來就像標準的共聚焦熒光顯微鏡。”它還可以利用一些熒光基團對活細胞進行成像,比如綠色或黃色的熒光蛋白和羅丹明衍生染料。
參數(shù)對比
盡管所有超分辨率技術(shù)在分辨率上都超越了傳統(tǒng)的光學(xué)顯微鏡,但彼此也各不相同。SIM大約將分辨率提高一倍,達到100 nm左右。PALM和STORM則可以分辨15 nm的目標。據(jù)Hell介紹,STED在活細胞中可提供30 nm的空間分辨率,在固定細胞中可達15 nm。
在涉及到特定應(yīng)用時,我們還必須考慮信噪比。在有些情況下,分辨率較低但信噪比較高可能會比相反情況(分辨率較高但信噪比較低)帶來更好的圖像。
圖像獲取的速度也相當重要,特別是對于活細胞。“所有的超分辨率技術(shù)都比常規(guī)的熒光成像技術(shù)要慢,”Stracy說。“PALM/STORM是*慢的,需要成千上萬幀來獲得單幅圖像,SIM需要幾十幀,而STED是一種掃描技術(shù),所以采集速度取決于視野的大小。”
除了活細胞或固定細胞成像,一些科學(xué)家也想了解對象如何移動。Stracy就很有興趣了解活細胞中生物系統(tǒng)的動力學(xué),而不僅僅是靜態(tài)圖像。他將PALM與單顆粒追蹤相結(jié)合,來分析活細胞中的動力學(xué)。通過這種方式,他可以在標記分子行使功能時直接追蹤它們。不過,他認為SIM并不適合研究這些分子水平的動態(tài)過程,但是由于獲取速度快,它特別適合觀察較大結(jié)構(gòu)的動力學(xué),如整條染色體。
聊聊標記
在許多超分辨率應(yīng)用中,標記真的很重要。目前也有一些公司提供相關(guān)產(chǎn)品。例如,德國美天旎和Stefan Hell創(chuàng)辦的公司Abberior合作,為超分辨顯微鏡染料提供定制抗體結(jié)合服務(wù)。
其他的一些公司也提供與之相匹配的標記。ChromoTek的營銷人員Christoph Eckert表示:“我們的Nano-Booster非常小,只有1.5 kDa,而且高度特異。”這些蛋白質(zhì)可與綠色和紅色熒光蛋白(GFP和RFP)相結(jié)合。它們來源于羊駝抗體片段,被稱為VHH或納米抗體,具有出色的結(jié)合性能,并且質(zhì)量穩(wěn)定,沒有批間差。這些標記適合各種超分辨率技術(shù),包括SIM、PALM、STORM和STED。
馬里蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)院的助理教授Ai-Hui Tang及其同事利用ChromoTek的GFP-Booster以及STORM,來探索神經(jīng)系統(tǒng)中的信息傳播。他們在突觸前和突觸后神經(jīng)元中發(fā)現(xiàn)了分子納米簇,將其稱之為納米柱(nanocolumn)。科學(xué)家認為,這種結(jié)構(gòu)表明中樞神經(jīng)系統(tǒng)采用簡單的原理來維持和調(diào)節(jié)突觸效率。
各種版本的超分辨率成像以及越來越多的方法正帶領(lǐng)科學(xué)家更深入地領(lǐng)略生物學(xué)奧秘。在打破了可見光的衍射極限后,生物學(xué)家甚至可以“嚴密監(jiān)視”細胞的行動。